正规机构做母子亲子鉴定以及需要什么样本一般由公安部门有关的科学技术检验机构进行，常用的亲子鉴定技术包含比对痕迹（特殊器官遗传特征）、蛋白质酶组成比对、碱基序列比对、血型比对等。针对不同的检验对象及所要比对的内容，检验所需提供的样本和报告内容也有所不同。
一般来说，母子亲子鉴定所需的样本一般包括母亲、儿童本人及父亲3方参加者的血清或其他组织液体、唾液及细胞样本，母婴亲子鉴定报告除基本信息外，一般会写出母亲、儿童及父亲三人的检测项及检测结果，以及引证文献，以证明结论的可靠性。根据需求，可以让本人及父亲签署报告书，以证明报告有效。
有很多正规机构都可以提供母子亲子鉴定服务，如佛山市法医中心、中国香港科学教育部实验室、广东省新阳检测技术应用研究所等。要做母子亲子鉴定，首先需准备相关样本。主要是包括母亲的血液样本、亲子的血液样本和亲子的口腔内脏样本，如粘膜、涎、唾液、牙齿等。血液样本在所有的母亲亲子鉴定实验室里都可以处理，而口腔内脏样本通常需要到专业的母子亲子鉴定中心来取采质本。实验结果一般会在25个工作日内公布，但是根据样本多少、实验量大小不同，会造成检测时间稍有延后。
做母子亲子鉴定的正规机构一般是具有法医物证鉴定资质的司法鉴定机构，这类机构需通过司法部门的审批，具备专业的鉴定设备、专业的技术人员以及规范的鉴定流程，以确保鉴定结果的准确性和法律效力。
母子亲子鉴定的样本类型有多种。常规的样本如母亲和孩子的血液，血液中含有丰富的DNA物质，采集时需由专业人员用专用采血管采集适量血液；还有口腔拭子，用干净的棉签在母亲和孩子的口腔内侧壁反复擦拭数下，采集适量的口腔黏膜细胞，这种样本采集相对简单、无创，比较常用。特殊情况下，也可采用毛发（需带有毛囊的毛发）、指甲（需剪取带有甲床组织的指甲）等样本，但这些特殊样本的DNA提取难度相对较大，对样本的保存和采集要求也更高，可能会影响鉴定的成功率和准确性，所以一般优先考虑常规样本。
