正规的机构做上户口亲子鉴定，一般是县级以上的基层医院或者省级的医院，和公安社会管理局发放的社区卫生服务中心等。在这些机构做上户口亲子鉴定，一般需要提供有以下几种主要的材料，分别是：1、亲子申请人两人本人的身份证复印件；2、户籍档案页复印件；3、本人和孩子的存根婚育证明；4、家长代表在本人所在镇乡、街道、村委会签字确认的关于亲子关系的证明材料；5、本人原件与孩子的婚育证明或其他亲子关系的证明材料；6、证件照、户口卡复印件等；7、本人和孩子的相关体检证明等。申请人到认证机构准备好上述材料后，医务人员会根据申请人的身份证和孩子的出生医学证明，对依法证明其亲子关系实行亲子鉴定，并发出亲子关系鉴定书。
正规机构做上户口亲子鉴定的有全国各地各级医院的儿童医疗机构、政府和社会公益组织、婚姻登记机关和其他有资质的当地法医侦查机构等。
申请机构通常需要提供申请人的有效身份证件，包括申请人本人的身份证、孩子的出生证明以及孩子的护照（如果孩子也有身份证的话）；另外，还需要孩子出生前和出生后关联申请人的证件材料，如出生时申请人的身份证、有关公司和公司的执照、工作单位证明、工作证等。申请机构会利用这些证件材料进行集中收集，进行复查和分析来证明所述关系，以满足申请机构的鉴定要求。
此外，如果申请人是孩子的亲生父母的必须提交了孩子户口信息，如果没有孩子户口信息，则需要提交孩子出生前和出生后申请人和孩子活动地的关联证件材料，如居住地户口信息等。
还有一些新兴的机构，如私人侦查社、信任中心等，也提供上户口亲子鉴定服务，不过政府机构还是建议优先按照正规机构进行鉴定。
上户口亲子鉴定属于司法亲子鉴定范畴，需由具备司法亲子鉴定资质的机构开展。正规机构需取得司法部门颁发的《司法鉴定许可证》，且鉴定项目包含“法医物证司法鉴定”，同时机构内的鉴定人员应持有司法鉴定人执业证。这类机构通常可通过司法部门官方网站查询确认资质。
办理上户口亲子鉴定时，一般需要以下证明材料：首先是身份证明，所有被鉴定人需提供有效身份证件，如身份证、户口本、出生医学证明（若有）、护照等；其次是委托书，部分情况需由相关部门（如派出所、公证处等）出具委托书，明确鉴定用途为上户口；此外，被鉴定人需亲自到机构现场，配合工作人员完成身份核验、拍照、采集样本等流程，确保鉴定过程的合法性和结果的有效性。具体要求可能因地区政策或实际情况有所差异，建议提前咨询当地户籍管理部门或所选鉴定机构，以获取准确信息。
